Ciao,
Aggiorno questo thread in quanto sono riuscito a risolvere e vi spiego come.
Ho installato su VM Player Kali come fosse una normale virtual machine dopodiché è comparsa fra l'elenco delle VM importabili in GNS3 (Edit>Preferences>GNS3 VM, VM Name).
A quel punto ho selezionato Kali come host VM.
La cosa interessante è che in una topologia, assieme allo switch Cisco IOSvL2, in questo modo è possibile usare anche un host, Kali nel caso specifico.
Inoltre ho sperimentato che GNS3 è in grado di vedere e permettervi di usare qualunque VM installata sul player.
Dunque se anche a voi dovesse dare lo stesso problema, sappiate che potete risolvere così.